Το 3ο Γυμνάσιο Αργοστολίου θεμελιώθηκε το 1975 και πρωτολειτούργησε το σχολικό έτος 1977-78 με τα εξής συστεγαζόμενα σχολεία:
α) Επαγγελματικό Λύκειο Αργοστολίου και
β) Μικτό Γυμνάσιο Αργοστολίου, το οποίο με τη Υπ. Απόφαση Δ28518α/18-7-79 (ΦΕΚ716/τ.β΄/29-8-79) μετονομάστηκε 3ο Γυμνάσιο Αργοστολίου.
Όλο το αρχείο του Μικτού Γυμνασίου φυλάγεται στο 3ο Γυμνάσιο. Έφυγε το 3ο Γυμνάσιο από το σχολικό κτίριο της οδού Χαροκόπου 62 το Σεπτέμβρη του 1998, επειδή αντί του ΕΠΑΛ δημιουργήθηκε το τότε Πολυκλαδικό και ήθελε αυξημένους-διευρυμένους χώρους.
Το σχολείο από το Σεπτέμβρη του 1998, μέχρι τις 24 Μαρτίου 2014, που επέστρεψε στην οδό Χαροκόπου 62, λειτούργησε στις εγκαταστάσεις του τότε 2ου Λυκείου στη οδό Μαζαράκη 4.
Διετέλεσαν Διευθυντές στο 3ο Γυμνάσιο Αργοστολίου:
1979-80 Δοκίδης Παναγιώτης [Μαθηματικός]
1980-84 Γεωργάτος Αριστομένης [Φιλόλογος]
1984-86 Κοσμάτος Άγγελος [Φυσικός]
1986-87 Αικατερινίδης Σπύρος [Φυσικός]
1987-88 Αικατερινίδη Φωκά Αγγιολίνα [Φυσικός]
1988-90 Αικατερινίδης Σπύρος [Φυσικός]
1990-92 Ανδρεάτου Μαρία [Φιλόλογος]
1992-96 Μοσχονά Καρκαβέλα Ευρώπη [Φιλόλογος]
1996-02 Καρλής Διονύσιος [Μαθηματικός]
2002-10 Ανδρεάτου Μαρία [Φιλόλογος]
2010-15 Γαλιατσάτος Νικόλαος [Φυσικός]
2015-17 Πετεινάτος Διονύσιος [Θεολόγος]
2017-23 Γαλιατσάτου Αλίκη [Φιλόλογος]
2023 – Λευκαδίτης Φώτιος [Γεωπόνος]